خاک دیاتومه، در واقع پودر فسیل باقیمانده از گیاهان دریایی میکروسکوپی با پوسته سیلیسی است. این مواد، قابلیت جذب آلودگی خوبی دارند و قادرند ذرات حتی تا حدود 5 میکرون را هم از آب جدا کنند. این فیلترها هم مانند فیلترهای شنی، نیاز به شستشوی معکوس دارند و فرآیند مشابهی برای آن انجام می‌شود. اما باید توجه داشت به دلیل سرطان‌زا بودن خاک سیلیس، استفاده از این نوع فیلتر، چندان مرسوم نمی باشد.
